Рекомендации по таксономической идентификации микроорганизмов для целей депонирования в БРЦ ВКПМ
В общем виде рекомендации коллекции для определения видовой
принадлежности:
Необходимо представить в текстовом формате последовательность рибосомального маркера (16s для прокариот, ITS для эукариот (реже 28s, 26s). Не менее 400-500 пар оснований, гомология не менее 97%. Чем длиннее фрагмент, тем выше процент требуемой гомологии. В случае, когда данной информации не достаточно (требуемый процент гомологии показывают несколько видов), необходимо предоставить результаты дополнительных уточняющих тестов, позволяющих сделать окончательное заключение (фенотипические, физиологические или анализ последовательности доп.мол.маркеров).
Полученные данные не должны противоречить описанию, приведенному в паспорте штамма.